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Dark Data: CASE - As Melhores Práticas para a Digitalização de Coleções Herbárias


Perceba como sua organização, dentre outras indústrias, pode aprender a apropriar-se de insights contidos na Dark Data.



A Sociedade Botânica da América está digitalizando suas coleções de amostras para aumentar seus dados de biodiversidade e abrir portas para novas descobertas científicas.

Imagine um Banco de Dados on-line, totalmente pesquisável, contendo milhões de registros de plantas, algasespécimes de fungos repleto de descobertas científicas.

Graças a um novo conjunto de módulos de fluxo de trabalho, espécimes de coleções, atualmente preservadas em herbários estarão ao alcance. Os módulos são fornecidos pela National Science Foundation (NSF) e Integrated Digitized Biocollections (iDigBio), que estão facilitando este esforço coletivo para unificar os projetos de digitalização.

"Existem cerca de 74 milhões de espécimes em Herbários da América do Norte e apenas uma fração destes está on-line", diz o especialista em digitalização da iDigBio, Dr. Gil Nelson. "Ter esses dados disponíveis na ponta dos dedos permitirá consultas avançadas e novas descobertas, assegurando a inclusão do chamado Dark Data contido numa porcentagem significativa de mais de 600 herbários ativos dos Estados Unidos".

De acordo com estimativas recentes, cerca de metade dos herbários americanos e universidades ainda têm de começar sua mobilização de dados. O Dr. Gil Nelson coordenou o desenvolvimento dos fluxos de trabalho, trabalhando ao lado de 28 outros autores contribuintes, para fornecer orientações às instituições a fim de que começassem programas de digitalização, além daqueles que procuram racionalizar e ajustar suas configurações de digitalização atual.

São 14 módulos personalizáveis, cada um organizado entre sete a 36 tarefas fáceis de seguir, cobrem tudo, desde a criação da estação de imagens para georreferenciamento. Eles também incluem métodos para organizar eventos de divulgação para a participação pública nas imagem e os dados de transcrição. Eles estão disponíveis para download como PDFs e arquivos de processamento de texto editáveis no GitHub e no iDigBio. A descrição completa dos fluxos de trabalho e seu desenvolvimento, junto com os arquivos de processamento de texto editáveis dos módulos de fluxo de trabalho, estão disponíveis na edição de setembro de Applications in Plant Sciences.

iDigBio lançou pela primeira vez grupos de trabalho em 2012 para enfrentar um Déficit de dados de biodiversidade on-line. Seis módulos iniciais provocaram um aumento na digitalização, evoluindo a digitalização das práticas curatoriais feitas por listas de tarefas mais abrangentes. O último conjunto de módulos é o resultado das colaborações que continuaram em reuniões virtuais e visitas a vários herbários. As oficinas do iDigBio envolveram mais de 50 pesquisadores com contribuições em 15 projetos de digitalização financiados pelo NSF.


Nelson prevê enormes conjuntos de dados multi-organismal que permitirá aos investigadores estudar as relações culturais ecológica e biologicamente. O trabalho da iDigBio está lançando as bases para um recurso online muito poderoso.

iDigBio oferece instrução, digitalização e recursos para as instituições nos Estados Unidos e é financiada pelo programa Advancing Digitization of Biodiversity Collections (ADBCda NSF.









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